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Tumorothèque


Présentation générale de la tumorothèque du Centre Paul Strauss

La tumorothèque du Centre Paul STRAUSS a débuté son activité en 1988. C’est une banque d'échantillons biologiques, incluant des échantillons tissulaires congelés et/ou inclus en paraffine, ainsi que des biopsies liquides (échantillons sanguins) et leurs dérivés (plasma). Ce matériel est associé aux données cliniques, pathologiques et/ou biologiques correspondantes. La tumorothèque a vocation à accueillir des collections d’échantillons préexistantes, ou à mettre les ressources biologiques conservées à disposition d’équipes de recherche académiques ou industrielles. Dans tous les cas, les demandes de mises en collection ou de mise à disposition doivent être réalisées le cadre de projets scientifiques dûment évalués au préalable par le Comité de Pilotage de la tumorothèque.

Démarche qualité et enjeux: La tumorothèque a mis en place une démarche qualité afin que l’ensemble de ses activités répondent de manière appropriée et efficace aux besoins et attentes des personnes ayant un intérêt dans son fonctionnement. Le fonctionnement de la tumorothèque est régi par un manuel qualité, et répond à la certification selon la norme NF S 96-900 par depuis le 21/12/2017. Cette certification a été reconduite en décembre 2020 par "AFNOR Certification" pour les activités suivantes : « réception, préparation, conservation et mise à disposition de tissus (tumeurs et tissus normaux) et produits dérivés humains (ADN, ARN, blocs paraffine, lames hémaluns). »

Pour rappel, l’application de la norme NF S 96-900 est compatible avec les exigences de l'ISO 9001 et les quatre recommandations métiers de l'Organisation de Coopération et de Développement Economiques (OCDE) :

    • La rigueur scientifique : pour garantir l'origine et la qualité des ressources biologiques,
    • La sécurité : pour contrôler l'émergence de nouvelles collections,
    • L'exigence éthique (prise en compte du cadre législatif existant),
    • La régulation économique, avec la mise en place de règles précises d'accès aux collections.

Enfin, la tumorothèque du Centre Paul Strauss a initié une démarche de certification selon la norme ISO 20387 Biotechnologie -
« Biobanking » - Exigences générales relatives au « Biobanking », dont l’obtention est envisagée à l’horizon 2024.



Les missions de la tumorothèque

La mission principale de la Tumorothèque du Centre Paul Strauss est de promouvoir et soutenir les activités de recherche translationnelle et clinique de l’Institut de Cancérologie Strasbourg Europe (ICANS).

Elle a également vocation à soutenir les projets de rechercge d’équipes extérieures, qu’elles soient françaises ou étrangères, académiques ou privées, et ce dans la limite de ses moyens et de la disponibilité de ses ressources biologiques.


Répondant à la définition des Centre de Ressources Biologiques (CRB) de l’OCDE, ses activités consistent en :

    • La gestion de collections « historiques » du Centre Paul Strauss (Tumeurs ORL, mammaires, gynécologiques, thyroïdes).
    • L’hébergement, temporaire ou définitif, de collections tumorales externes déjà existantes ou la mise en collection de nouveaux échantillons de manière prospective.
    • La prestation de services concernant la conservation d’échantillons prélevés dans la cadre de l’activité de recherche clinique de l’ICANS.
    • L’accompagnement, en amont, des demandeurs pour la réalisation de leurs projets, et la valorisation en cours de projet des ressources biologiques conservées.
    • La mise en œuvre, pour les demandeurs, la mise en collection, la réception et la préparation d’échantillons, l’extraction de dérivés (ADN, ARN, microARN, plasma), et la conservation des échantillons et de leurs dérivés.
    • La garantie de la conformité de ses processus aux bonnes pratiques de laboratoire, à la législation en vigueur et aux exigences de la norme NF S 96-900.

La Tumorothèque du CPS met tout en œuvre pour remplir ces missions dans le respect :
  • de la législation et de la réglementation concernant la constitution de collections, la préparation, la conservation et la mise à disposition des ressources biologiques humaines.
  • des aspects éthiques.
  • de la confidentialité et de l’impartialité.
  • de la qualité selon les exigences de la norme NF S96-900 des CRB.


Conditions d'accès aux ressources biologiques et aux services de la Tumorothèque:

    •  Une demande de mise en collection ou de mise à disposition de ressources biologiques incluant le détail du projet scientifique est complétée par les déposants ou les demandeurs, et est adressée par courriel (tumorotheque-CPS@icans.eu) au personnel de la tumorothèque.
    • La faisabilité du projet (besoins techniques et humains) ainsi que les surcoûts et les charges éventuelles sont appréciés par le personnel de la tumorothèque.
    • Les projets dont la faisabilité est validée sont soumis au Comité de Pilotage de la tumorothèque qui en évalue la conformité avec le projet médico-scientifique de l’ICANS, l’absence de conflit d’intérêt avec son plan stratégique, et le potentiel de valorisation des échantillons.
    • En cas d’acceptation de la demande par le COPIL, un accord de mise en collection ou de mise à disposition d’échantillons est établi avec le demandeur. Cet accord établi, sous forme de convention, les besoins, attentes et engagements des partenaires, les conditions financières d’accès aux ressources biologiques, et les modalités de protection de la propriété intellectuelle.
      En fonction du type de convention signée, la tumorothèque pourrait être co-autrice ou citée/remerciée dans les publications.
    • La tumorothèque accompagne les déposants et/ou les demandeurs à travers l’organisation des circuits logistiques internes ou externes.
    • La satisfaction des déposants et des demandeurs est évaluée par questionnaire, et un retour d'information sur l'utilisation et la valorisation des ressources biologiques est attendu de la part des demandeurs.



Les personnes à contacter pour vos demandes et l’accompagnement de vos projets sont listés ci-dessous et sont joignables à l’adresse tumorotheque-CPS@icans.eu :

  • Dr Khalil BOURAHLA, Responsable de la tumorothèque
  • Dr Alain JUNG, Référent scientifique de la tumorothèque
  • Sonia LEDRAPPIER, Responsable Qualité Opérationnelle (RQO)
  • Amandine KOBLER, Technicienne de laboratoire



Indicateurs de performance de la Tumorothèque du Centre Paul Strauss :

  • L’enquête menée auprès des utilisateurs sur la période 2020-2023, par l’intermédiaire d’un questionnaire, met en évidence les taux de satisfaction suivants : 
    • Le délai entre le dépôt du projet et son acceptation est-il raisonnable : 77% de réponse « oui »
    • Le délai annoncé pour l’envoi des échantillons a-t-il était respecté : 100% de réponse « oui »
    • Conformité des échantillons par rapport aux critères d’inclusion : 100% de réponse « oui »
    • Conformité des données fournies par rapport aux attentes : 100% de réponse « oui »
    • Taux de satisfaction par rapport à la qualité des échantillons fournis : 100%
  • Sur la période 2020-2023, le délai moyen de réponse aux demandes était de 30 jours
  • Nombre de partenariats établis sur la période 2020-2023: 12
  • Tenant compte des collections étant totalement ou partiellement sous embargo, le taux de disponibilité des échantillons
    au 1
    er Janvier 2024 est de 79%.

Catalogue des ressources biologiques

La tumorothèque conserve des échantillons biologiques de pathologies cancéreuses et de tissus sains associés.

Diverses localisations anatomiques et types d’échantillons *:

  • Échantillons tissulaires (échantillons cryoconservés et blocs paraffines) :
    • Voies aérodigestives supérieures (VADS) : 4204 tissus tumoraux et 2597 tissus sains
    • Thyroïde : 268 tissus pathologiques
    • Sein : 831 tumeurs et 70 tissus sains
    • Glioblastomes : 107 tissus tumoraux
    • Tumeurs rénales à translocation : 203 tissus tumoraux
    • Autres localisations (ex : tumeurs gynécologiques) : 107 tumeurs 
  • Biopsies liquides
    • Sang total (Cancers mammaires) : 2994 aliquots
    • Plasma (Cancers des VADS ; Cancer du rectum) : 91 aliquots

  • Dérivés disponibles
    • Échantillons fixés et inclus en paraffine: 30 463 échantillons (cancer des VADS :  cancers mammaires ; cancers rénaux ; gliomes)
    • ADN : 1839 échantillons (cancer des VADS : cancers mammaire)
    • ARN : 2465 échantillons (cancer des VADS : cancers mammaires)
    • miRNA : 431 échantillons (cancer des VADS)
    • ADN tumoral circulant: 1 échantillon (cancer du rectum) 

  * données à titre indicatif au 15/01/2024. Des données plus précises peuvent être fournies à la demande pour chaque collection.


Tarification

Le coût de l'utilisation des ressources biologiques doit être intégré dans les demandes de financement des projets de recherche.

Évaluation au niveau national du coût d'un échantillon (selon l’Institut National du Cancer) :

  Académiques Privés

Bloc paraffine

90 € 110 €

Coupes bloc paraffine
(lames blanches)

100 € 150 €
ADN tumoral 100 € 200 €
ARN tumoral 130 € 200 €

 Ces tarifs sont donnés à titre indicatif. Pour plus de précision merci de contacter l’équipe de la tumorothèque.